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人间最美四月天,不负春光和实验

美吉生物2020-07-13 11:27:54

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四月,

桃花夭夭,

渌水盈盈,

万象始更新,

是春天中的春天。

然鹅。。。

在这个盎然春意的时节里,经历刚刚的开题之后,筒子们开始苏醒,伸展筋骨开始准备实验材料,进入实验狗的阶段。但是面对形形色色的材料,却无处下手。莫慌,聪慧的小美帮你解决这些小case

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什么样的材料算是自然群体材料呢?


自然界收集而来的,彼此间没有一定的亲缘关系,又分别分布在一定区域并适应当地环境的一类材料为自然群体材料,例如不同地域生长环境下的山雀。

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家系群体的特征是什么?


从种质资源中挑选的有目标性状差异的两个材料,作为亲本(父母本),杂交之后构建的具有表型分离的一群子代个体集合的一类材料为家系群体材料。符合这样子的群体类型有F1F2BCRIL等,小美提醒大家:一般这样的群体在做实验的时候最好准备>150个个体,越多越好呐!

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植物样本取材注意哪些呢?


采摘新鲜幼嫩的叶片鲜艳的花朵、成熟的种子2g左右,优先选择幼嫩的叶片,因为果实、种子、花及其他组织中有多重化学成分,影响基因组DNA提取的质量。取完的叶片先用75%的酒精擦拭组织的表面,去离子水冲洗3次,吸干水分,至于锡箔纸或者封口袋中并标注,立即液氮速冻,贝博网站多少保存,干冰贝博app体育。

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动物样本取样时注意哪些呢?


动物的肌肉、肝脏组织是最适的取材部位,组织部分总量2g左右。取材后,用PBS0.9%生理盐水漂洗,以去除血渍和污物,并剔除结缔组织和脂肪组织等,吸干水分,液氮速冻,贝博网站多少保存,干冰贝博app体育。

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血样有什么要求?


取外周静脉血2ml,血细胞总量满足大于106,加入抗凝剂柠檬酸EDTA(乙二胺四乙酸二胺),2-8℃保存,生物冰袋贝博app体育;-20℃-70℃保存,干冰贝博app体育。

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如果送DNA的话,根据不同的实验有具体不同的要求?


针对目前群体遗传学研究中利用的两种测序技术:重测序和简化基因组,这两种测序方式不同,针对DNA样本的需求是不同的。重测序(PE文库)建库要求的DNA总量大于2ug,质量浓度>25ng/ul;简化基因组(RADGBS)测序建库的DAN总量大于800ng,质量浓度>10ng/ul。置于1.5ml2.0ml的离心管内,生物冰袋或者干冰贝博app体育就可以了。

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DNA样本质检要经历那些关卡?


符合高通量测序建库要求的DNA样本是需要经过重重检验的,这里的多重关卡包括DNA的纯度、浓度、完整性DNA总量检验等。利用NanoDrop2000检验其纯度,利用TBS-380检验其浓度,利用1%琼脂糖凝胶电泳检验其完整性,根据三者的结果计算DNA总量。

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质检中我们常常见到的230260280分别是什么指标?


260指核酸(DNARNA);280代表蛋白;230代表盐离子及其他有机化合物(多糖)。当OD260/2801.8时,可能是蛋白污染所致,这个时候可以通过增加酚抽提消除这种影响;当OD260/2302.0时说明可能有盐和苯酚残留,可以再次沉淀和利用70%的乙醇进行洗涤去除以上残留物质。


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动植物基因组  文案|半仙

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